法院长期冻结住房公积金账户在特定情况下合法。依据《相关法律法规》，若被执行人有未履行的生效法律文书义务，法院可冻结其住房公积金账户以防止财产转移。长期不处理可能导致账户持续冻结，影响您的住房公积金使用权益。
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常见处理方式为履行法院判决或申请解冻。若已履行判决，应向法院申请解冻；若认为冻结有误，可提出异议并申请解冻。选择时需根据自身实际情况和法院判决情况来决定。
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住房公积金被冻结应处理。操作如下：1.若已履行法院判决，收集履行证明，向法院申请解冻；2.若认为冻结有误，收集证据，向法院提出异议并申请解冻；3.了解冻结期限，若超期未解冻，可申请解冻并追究相关责任。